在色譜分析中，如何選擇最佳的色譜條件以實現最理想的分離，是色譜工作者的重要工作。色譜是一種分離分析的手段，分離是核心，因此可以說擔負分離作用的色譜柱是色譜系統(tǒng)的心臟。因此選擇一個合適的色譜柱非常重要。

對色譜柱的基礎要求是：柱效高、選擇性好，分析速度快等。目前市售的用于ＨＰＬＣ的各種色譜柱種類繁多，從色譜柱填料來分，可分為硅膠基質和有機雜化球基質的色譜柱，還有不同長短、不同微粒大小的色譜柱。

色譜柱的選擇可根據待分析樣品的極性、分子量大小、是否可溶于水等因素來考慮。如樣品分子量大于２０００的，可溶于水的，可選擇凝膠色譜柱、大孔徑反相色譜柱、大孔徑離子交換色譜柱。分子量小于２０００的，溶于有機相的，可選擇正相模式色譜柱。溶于水，可電離的樣品可選擇反相模式色譜柱或離子交換或未經涂漬親水模式的色譜柱等。

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